Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLTCQ00610 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms