Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CBX1P83916 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CBX1P83916 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CBX1P83916 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms