Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms