Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms