Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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