Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVPABLB-1P60509 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms