Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP107P57740 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms