Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGGT1BP53609 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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