Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KPNA1P52294 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KPNA1P52294 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KPNA1P52294 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KPNA1P52294 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KPNA1P52294 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KPNA1P52294 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KPNA1P52294 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KPNA1P52294 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms