Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERFP50548 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERFP50548 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERFP50548 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERFP50548 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERFP50548 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERFP50548 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERFP50548 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERFP50548 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERFP50548 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERFP50548 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERFP50548 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERFP50548 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms