Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP153P49790 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP153P49790 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP153P49790 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP153P49790 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP153P49790 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP153P49790 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP153P49790 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms