Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTPAP49638 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTPAP49638 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTPAP49638 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTPAP49638 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTPAP49638 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTPAP49638 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTPAP49638 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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