Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLMP48507 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCLMP48507 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GCLMP48507 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GCLMP48507 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCLMP48507 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCLMP48507 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms