Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATRXP46100 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATRXP46100 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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