Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms