Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPN7P35236 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms