Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA9P31269 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms