Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRMP28827 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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