Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRGP23470 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms