Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHCEP18577 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHCEP18577 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHCEP18577 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHCEP18577 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RHCEP18577 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHCEP18577 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHCEP18577 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHCEP18577 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHCEP18577 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHCEP18577 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHCEP18577 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHCEP18577 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHCEP18577 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHCEP18577 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHCEP18577 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHCEP18577 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHCEP18577 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms