Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
IFITM1P13164 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms