Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM10L1P0DMW3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms