Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLR1AO95602 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1AO95602 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms