Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVILO95425 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVILO95425 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVILO95425 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms