Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNSO60931 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNSO60931 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNSO60931 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNSO60931 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNSO60931 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNSO60931 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNSO60931 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms