Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF4O60810 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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