Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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