Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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