Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TO15178 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TO15178 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TO15178 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TO15178 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TO15178 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TO15178 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TO15178 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TO15178 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TO15178 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TO15178 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TO15178 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TO15178 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TO15178 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TO15178 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TO15178 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TO15178 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TO15178 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TO15178 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TO15178 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TO15178 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TO15178 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TO15178 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TO15178 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TO15178 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms