Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD8O14715 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms