Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOC4-APOC2K7ER74 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms