Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms