Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA5E9PKD4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms