Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HHLA1C9JL84 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HHLA1C9JL84 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms