Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PATL2C9JE40 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms