Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C4orf47A7E2U8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf47A7E2U8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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