Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNPO3Q9Y5L0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms