Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms