Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms