Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNRC6BQ9UPQ9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms