Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms