Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms