Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSFQ9UBX1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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