Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DKK3Q9UBP4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms