Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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