Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP36Q9P275 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms