Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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