Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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HOXC10Q9NYD6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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HOXC10Q9NYD6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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HOXC10Q9NYD6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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HOXC10Q9NYD6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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HOXC10Q9NYD6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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HOXC10Q9NYD6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC10Q9NYD6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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