Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVK13-1Q9NX77 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms