Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED17Q9NVC6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms